Ook watervogels moeten volledig afgeschermd worden. Nederland is het meest dichtbevolkte wilde watervogelgebied van Europa. Het algemene risico van insleep wordt voor de komende vogeltrekperiode voor het gehele land zodanig hoog geacht dat vaccineren of afschermen noodzakelijk is. Van trekvogels is bekend dat zij het liefst neerstrijken bij of in de buurt van soortgenoten. De uitverkoren soortgenoten kunnen gehouden watervogels zijn. Het aanbrengen van rood witte tinten is onvoldoende gebleken om contact met wilde vogels te voorkomen. Het risico van insleep van Aviaire Influenza via gehouden watervogels is daarom aanzienlijk te noemen. In Denemarken en Duitsland bijvoorbeeld is het H5N1-virus via wilde vogels naar gehouden niet afgeschermde watervogels overgebracht.

Vanwege de praktische problemen bij het afschermen van waterpartijen en het feit dat het afschermen met linten niet bijdraagt aan de vermindering van de kans op insleep is in Brussel gepleit voor de uitbreiding van het aantal soorten dat gevaccineerd mag worden. Hiervoor is toestemming verkregen. De volgende dieren kunnen sinds 1 augustus jl. gevaccineerd worden: kippen, kwartels, patrijzen, fazanten, pauwen, kalkoenen en andere hoenderachtigen, alsook, ganzen, zwanen, eenden en andere eendachtigen. Ook de procedure is wat vereenvoudigd, waardoor de kosten lager zijn dan voorheen.  

Vogels die volledig gevaccineerd zijn (vanaf 1 week na de tweede vaccinatie), hoeven niet afgeschermd te worden. Voor gevaccineerde vogels geldt wel dat water en voedsel in een ondoorlaatbaar overdekte ruimte moeten worden gegeven. Schriftelijke informatie over vaccinatie van uw pluimvee kunt u vinden bij dierenartsen en dierenspeciaalzaken en natuurlijk op de website van het ministerie van Landbouw, Natuur en Voedselkwaliteit www.minlnv.nl/vogelgriep

Daar staat ook een volledige lijst op van vogels die gevaccineerd mogen worden.